Η Ελένη Κονδύλη γεννήθηκε στην Αθήνα και μεγάλωσε στο Βέλγιο. Σπούδασε  ρωμανικές φιλολογίες (γαλλική και ιταλική), με κύριο ενδιαφέρον την ανάλυση κειμένων και την ανάλυση της σχέσης μεταξύ κειμένου και εικόνας, κατόπιν Βυζαντινή και Αραβική φιλολογία και ιστορία. Εκπόνησε την διδακτορική διατριβή της στον τομέα της συγκριτικής αραβικής λογοτεχνίας.

Εργάστηκε στο Βέλγιο σε διάφορα ερευνητικά κέντρα (Κέντρο Αραβικής Φιλοσοφίας και Ινστιτούτο Ανατολικών Σπουδών του Université Catholique de Louvain,  Εθνικό Ίδρυμα Ερευνών του Βελγίου, περιοδικό Ανατολικών Φιλολογιών Le Muséon).

Από το 1996 υπηρέτησε ως διδακτικό και ερευνητικό προσωπικό στο Εθνικό και Καποδιστριακό Πανεπιστήμιο Αθηνών με γνωστικό αντικείμενο την Αραβολογία. Επίσης δίδαξε για δεκαετία αμισθί στην Ανώτατη Σχολή Καλών Τεχνών. Είναι πλέον Ομότιμη Καθηγήτρια.

Δημιούργησε και δίδαξε πανεπιστημιακά μαθήματα (όπως: - Αραβικός Πολιτισμός, - Εισαγωγή στην Λογοτεχνία των Αράβων, - Εισαγωγή στο Ισλάμ, Θέματα Αραβικής Γραμματολογίας, Τεχνών και Πολιτισμού, -Αραβικός Πολιτισμός και Τέχνη, -Βυζάντιο και Ισλαμικός Κόσμος, -Γαλλόφωνη Λογοτεχνία του Αραβικού Κόσμου…). 

Για δύο δεκαετίες (2000-2021) εκπροσώπησε την Ελλάδα στην European Association for Middle Eastern Studies.

Από το συγγραφικό της έργο πέραν των επιστημονικών άρθρων: 

• Stéphanitès kai Ichnélatès, traduction du Kitab Kalîla wa-Dimna, Peeters, Leuven, Paris 1997
• Εισαγωγή στη Λογοτεχνία των Αράβων (πρώτη έκδοση το 2001) 
• Άδωνης, Οι Αναλογίες και οι Αρχές, 2003 και 2019
• Αραβικός Πολιτισμός (πρώτη έκδοση το 2008)
• Προβολές και Αντανακλάσεις. Ελληνικά και Αραβικά καιτά τους Μέσους Χρόνους, Αθήνα 2020
• Το Χρονικό της Μεσογείου. Βυζάντιο, Ισλάμ, Δύση (πρώτη και μοναδική έκδοση το 2020,

Καθώς και δύο ποιητικές συλλογές.

Διακρίσεις: 

1993: Βραβείο Τάξης Γραμμάτων της Ακαδημίας Γραμμάτων, Επιστημών και Καλών Τεχνών 
2007: Βραβείο Fagnan 2007 (ετήσιο βραβείο σημιτικών σπουδών στο γαλλόφωνο χώρο) 
2008: Μετάλλιο Υπουργείο Ανώτατης Παιδείας Αιγύπτου